Estava lendo o post “PulseAudio vs. AudioFlinger: Fight!” do Arun Raghavan e descobri algo muito interessante:
A empresa Collabora criou um programa, chamado androgenizer, que simplifica o porte de aplicações do Linux para o Android, convertendo os arquivos autotools em Makefiles padrões do Android.
Para baixar o androgenizer:
http://cgit.collabora.com/git/user/derek/androgenizer.git/
Ainda não testei, mas resolvi documentar este dica pois muito frequentemente temos que portar aplicações do Linux para o Android.